Second volet : Virus SARS-COV-2 et syndrome respiratoire COVID19 (19 pour 2019)
F.A., 24 avril 2020
Le virus responsable de l’épidémie actuelle est un coronavirus, c’est-à-dire un cousin des coronavirus qui causent le
rhume (mais d’autres virus sont également à l’origine des rhumes). La grippe est elle causée par une autre virus, le
virus Influenza (d’où son nom flu en anglais). C’est surtout le frère de deux épidémies meurtrières l’une en 2002, en
Chine due au coronavirus SARS-COV, l’autre en 2012 et actuellement, dans les pays arabes et au Proche-Orient, due
au coronavirus MERS-COV. Les épidémies précédentes ont pu être contenues et n’ont pas dégénéré en pandémie
planétaire, ce qui pose la question de savoir ce que le nouveau virus a en plus ou en moins pour être aussi virulent.
La maladie affecte les voies respiratoires et évolue dans sa forme la plus aigue vers une pneumopathie.
Les symptômes
– La fièvre, mais pas toujours
– Les quintes violentes de toux
– La perte du gout et de l’odorat, mais pas toujours
– Une violente fatigue intervenant brutalement et repartant tout aussi brutalement dans le meilleur des cas
– De violentes migraines, mais pas toujours
– Des malaises digestifs, mais pas toujours
– Une ténacité de la maladie, qui peut dans certains cas, repartir et revenir après une première infection
Une particularité de la maladie est que beaucoup de personnes peuvent être infectés jusqu’à 14 jours (incubation de
5 à 14 jours, voire plus selon les études chinoises) sans présenter de symptômes avant de développer la maladie.
Cependant, pendant ce laps de temps, ils infectent tout leur entourage. Ce sont les malades asymptomatiques.
Il a été noté très tôt également que la charge virale par personne était plus importante que précédemment et que
plus de personnes pouvaient être infectées en même temps par une seule personne.
Côté symptômes, il faut prendre conscience que certains ne sont pas forcément l’indication d’infection COVID19 :
une fausse fièvre peut être générée par de l’anxiété (d’où la nécessité de se relaxer- on ressent souvent les
symptômes d’une affection rien qu’en lisant leur description dans le Larousse Médical), une toux peut être
provoquée par une allergie aux pollens ou par l’usage excessif de désinfectants pour nettoyer la maison, les malaises
digestifs par une mauvaise digestion, la fatigue par des travaux de jardinage exténuants, etc. Par ailleurs, la vie
continue et avec elle, les petits maux chroniques que l’on traîne avec leurs symptômes propres, telle
l’hypertension,…
Par conséquent, l’infection est détectée avec certitude par
– la difficulté à respirer (détresse respiratoire)
– la détection du virus grâce à des tests:
– tout d’abord un test de type PCR qui détecte la présence de la molécule d’ARN c’est-à-dire du
« génome viral « ARN encapsidé dans le virus,
– et quelques jours après, d’un test sérologique qui détecte la présence d’anticorps en réponse au
passage du COVID19 dans l’organisme. Face à un virus quel qu’il soit, un bouclier d’anticorps est
généré pour défendre l’organisme. Celui-ci est plus ou moins temporaire (ou plus ou moins définitif).
– et ce n’est malheureusement pas souhaitable, par l’infection de personnes de l’entourage ou
croisées
L’analogie maintenant évidente avec les virus SARS-COV et MERS-COV, n’a pas été faite dès le début de l’épidémie.
Se rappeler qu’il a d’abord été question de grippe, au pire d’un virus inconnu avant que la similitude soit reconnue.
Pour ma part, cette similitude a été claire très tôt car _ et personne ne s’y est encore intéressé_ les cinq dernières
années en France ont déjà vu des épidémies de rhume grippal présentant des symptômes voisins de ceux observés
actuellement bien que la plupart du temps plus bénins. Se pose la question de savoir si dans le registre des hôpitaux,
ou des généralistes / ORL, on a décelé une recrudescence de bronchites, engines, laryngites atypiques, ou une
recrudescence des pneumopathies ? n’aurait-on pas à tort attribué ces infections à la grippe saisonnière ?
L’analogie avec les précédents SARS-COV et MERS-COV est devenue évidente lorsque l’épidémie en Chine a été
connue, sur le lieu-même la précédente épidémie de SARS-COV, lorsqu’il a été clair que l’épidémie ne serait pas
contenue comme précédemment et que son développement était aiguisé par les voyages interplanétaires.
Qui est atteint ?
Apparemment, aussi bien les jeunes que les moins jeunes, contrairement à ce qui était supposé au départ.
Comment se transmet le virus ?
1_En premier lieu, comme pour les rhumes, par la toux et les postillons (fines gouttelettes dispersées dans l’air).
2_En second lieu, selon des études du NIH américain et des études chinoises, simplement en ouvrant la bouche et en
parlant, ceci jusqu’à 4m (raison supplémentaire pour imposer la distanciation entre individus et le confinement).
La transmission aéroportée n’a pas été immédiatement reconnue. Elle était personnellement évidente en raison de
de l’observation de l’analogie avec les rhumes ou autres affections respiratoires, et de la nécessité en cas de rhume
de se protéger des courants d’air (ainsi que des coups de froid, c’est-à-dire des refroidissements brutaux et des
variations brutales de température)_ A noter que nous avons connu de nombreuses instabilités de température,
ainsi que nombre de tempêtes inhabituellement violentes, ces dernières semaines).
Dans quels organes se loge le virus ? où le retrouve-t-on ?
– Dans les voies respiratoires, riches en récepteur ACE2 ancrage du virus sur les cellules
– Mais aussi dans l’intestin, également riche en récepteur ACE2
– Dans le sang, artères et vaisseaux capillaires, riches en ACE2
– Dans les selles, et sauf erreur de ma part, dans les urines
Ce qui définit également les éventuelles voies d’infection : postillons, voix, selles, sang, urine.
Surfaces infectées et désinfection
Le virus a besoin d’un hôte cellulaire pour survivre et se multiplier.
S’il quitte un hôte infecté et n’atterrit pas immédiatement chez un autre individu, il va rester un moment en
suspension dans l’air et peut-être se désintégrer à ce stade. Bonne nouvelle du jour : une étude américaine indique,
si j’ai bien compris, que le virus est détruit dans l’air par conjonction de douces températures, d’ensoleillement
_donc soit grâce aux rayons bronzants UV du soleil, et peut-être grâce à d’autres rayonnements_, et d’humidité.
Sinon, par manutention ou autrement, il va se déposer sur une surface : carton d’emballage, courrier, plastique,
acier, et y subsister plusieurs heures, voire plusieurs jours. Il y a pléthore de conseils et d’avis maintenant à ce sujet.
Heureusement, en absence d’hôte cellulaire, il ne pourra pas survivre et finira par se désintégrer (sauf si des
conditions exceptionnelles sont réunies, celles employées par exemple dans les laboratoires scientifiques pour
conserver les virus, telles les basses températures) . C’est pourquoi il est conseillé de ne pas déballer tout de suite
ses achats (attendre plusieurs heures, voire plusieurs jours) en dehors de ce qui doit être mis immédiatement au
réfrigérateur.
La désinfection des surfaces à l’eau de Javel diluée (ou au Dakin de pharmacie par exemple), à l’alcool (éthanol de
pharmacie), au savon, complète la prévention.
Le virus en goguette peut également atterrir sur la peau ou le pelage d’un animal domestique présumément sans
l’infecter si un lavage au savon intervient précocement.
Le virus se retrouve dans les circuits d’air conditionné et les bouches de ventilation, comme plusieurs études le
prouvent, qui recommandent de filtrer l’air. Dans les hôpitaux COVID19 en Chine, la ventilation était arrêtée.
Dans les laboratoires manipulant les bactéries et les virus, les hottes de manipulation sont décontaminées aux UV
(rayons bronzants du soleil). Est-il possible d’envisager d’utiliser des UV pour désinfecter, l’air par exemple ?
Animaux domestiques
Les animaux domestiques (chats, chiens) peuvent être infectés par le virus et se retrouve dans leurs selles et
présumément leurs urines. La question se pose de savoir s’ils peuvent transmettre le virus ou si leur maître peut les
infecter : pas très clair à l’heure actuelle, donc prudence.
C’est l’une des raisons pour lesquelles il faut désinfecter les semelles de ses chaussures en rentrant chez soi.
Masques
Les masques protègent de l’infection (des postillons et de la respiration) dans une certaine mesure à condition d’être
changés plusieurs fois par jour, d’avoir un tissage serré, d’être lavés après chaque sortie s’ils sont en tissu (à 60°C
pendant au moins 30 minutes), de recouvrir nez, bouche et menton : là-aussi, il y a pléthore de conseils avisés.
A eux seuls cependant, ils ne vont pas prévenir l’infection. Ils doivent être associés à la protection des mains, de la
manutention et au lavage des mains, à la distanciation, voire au confinement.
Alimentation / eau / tests environnementaux
Le virus étant sensible à la chaleur, il est préférable de cuire les aliments. Le virus pouvant infecter les animaux, la
cuisson à coeur de la viande doit être privilégiée.
Par ailleurs, les selles et les urines contaminent les eaux usées (cela a été prouvé aux Pays-Bas et dernièrement en
France). Des traces de virus ont été retrouvées dans l’eau non potable à Paris. Apparemment rien dans l’eau potable
actuellement en raison des systèmes de désinfection et de filtration.
Une eau souillée pourrait contaminer les légumes et les fruits que l’on souhaite consommer crus. Mais à ma
connaissance, les plantes sont infectées par des virus spécifiques aux plantes (par exemple celui qui cause la
mosaïque du tabac ou de la tomate), distincts de ceux qui infectent l’homme et l’animal. Donc les virus ne resterait
qu’en surface. On en sait pas encore combien de temps le coronavirus persiste à la surface d’un légume ou d’un fruit
et combien de temps il faut attendre pour que le virus se désagrège. Dans le doute, je lave au savon et ébouillante
pendant plusieurs minutes tout légume ou fruit que je souhaiterais consommer cru.
A un moment donné, les salades vertes en supermarché étaient vendues irradiées aux UV. J’ignore si c’est toujours
le cas. Ce n’est pas très naturel et personnellement, je préfère me passer de salade en période d’épidémie, mais si
on y tient vraiment ?
Il est clair que des tests environnementaux (eau et air, tout au moins à proximité des lieux infectés) doivent être
réalisés autant que faire se peut.
Des tests sur les légumes et fruits en provenance des régions ou pays infectés seraient également les bienvenus.
…La suite au prochain numéro…